Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
THSD7AQ9UPZ6 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
THSD7AQ9UPZ6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms