Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PHF8Q9UPP1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PHF8Q9UPP1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms