Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM44

HHLA2, HERV-H LTR-associating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA2Q9UM44 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HHLA2Q9UM44 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HHLA2Q9UM44 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms