Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NRXN1Q9ULB1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NRXN1Q9ULB1 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms