Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TSPAN16Q9UKR8 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms