Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP21Q9UK80 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP21Q9UK80 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms