Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms