Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CTNNA3Q9UI47 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms