Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
POLKQ9UBT6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
POLKQ9UBT6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms