Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
VPS29Q9UBQ0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms