Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TRPC4Q9UBN4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms