Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP35Q9P2H5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP35Q9P2H5 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
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