Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC180Q9P1Z9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC35.45■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CCDC180Q9P1Z9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
CCDC180Q9P1Z9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms