Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNK4Q9NYG8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms