Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GDAP2Q9NXN4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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