Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LMBRD1Q9NUN5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms