Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
GJB4Q9NTQ9 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GJB4Q9NTQ9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms