Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RRP7BPQ9NSQ0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms