Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VPS45Q9NRW7 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VPS45Q9NRW7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms