Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RAB6BQ9NRW1 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB6BQ9NRW1 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms