Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FZD3Q9NPG1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FZD3Q9NPG1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms