Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W1

MS4A6A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6AQ9H2W1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
MS4A6AQ9H2W1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
MS4A6AQ9H2W1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms