Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CEP44Q9C0F1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CEP44Q9C0F1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms