Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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FOXQ1Q9C009 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FOXQ1Q9C009 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
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FOXQ1Q9C009 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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FOXQ1Q9C009 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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FOXQ1Q9C009 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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FOXQ1Q9C009 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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FOXQ1Q9C009 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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FOXQ1Q9C009 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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FOXQ1Q9C009 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
FOXQ1Q9C009 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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