Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RSPO3Q9BXY4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms