Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BRIP1Q9BX63 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms