Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IFT27Q9BW83 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms