Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KATNB1Q9BVA0 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KATNB1Q9BVA0 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms