Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NDC1Q9BTX1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms