Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABRG3Q99928 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms