Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MEIS3Q99687 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MEIS3Q99687 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms