Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIN3AQ96ST3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms