Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN18Q96SJ8 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN18Q96SJ8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN18Q96SJ8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN18Q96SJ8 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN18Q96SJ8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSPAN18Q96SJ8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSPAN18Q96SJ8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms