Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC4A9Q96Q91 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC4A9Q96Q91 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms