Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TPD52L3Q96J77 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TPD52L3Q96J77 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms