Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL359918.2-201ENST00000412311 497 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 NDUFC1-206ENST00000505036 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ADAL-204ENST00000562188 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AP001099.1-201ENST00000579385 855 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 KRTAP4-6-201ENST00000345847 1055 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MS4A3Q96HJ5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms