Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SCARF2Q96GP6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms