Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DNAJA3Q96EY1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms