Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CMTM5Q96DZ9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CMTM5Q96DZ9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms