Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NMD3Q96D46 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NMD3Q96D46 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms