Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NXNL1Q96CM4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NXNL1Q96CM4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms