Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
EFHD2Q96C19 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EFHD2Q96C19 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms