Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SMARCE1Q969G3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms