Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAAF4Q8WXU2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAAF4Q8WXU2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms