Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GIPC3Q8TF64 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms