Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

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Length 659 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSH3Q8TE77 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
SSH3Q8TE77 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSH3Q8TE77 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSH3Q8TE77 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSH3Q8TE77 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSH3Q8TE77 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SSH3Q8TE77 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SSH3Q8TE77 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
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