Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATL2Q8NHH9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms