Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BHLHE23Q8NDY6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms