Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CARMIL3Q8ND23 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms