Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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FAM71DQ8N9W8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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FAM71DQ8N9W8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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FAM71DQ8N9W8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
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FAM71DQ8N9W8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
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FAM71DQ8N9W8 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FAM71DQ8N9W8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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FAM71DQ8N9W8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FAM71DQ8N9W8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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